托木斯克国立大学（原沙皇俄国托木斯克帝国大学）建于1878年。该校是俄罗斯西伯利亚地区和远东第一所高校，其任务是以高等教育和基础科学研究为基础，为前苏联和俄罗斯已培养了10万多名优秀专业人才。托木斯克国立大学是一所大型集教育和科研为一体的综合性大学。它是四所最顶尖的俄罗斯国立大学之一，仅次于莫斯科大学，圣彼得堡国立大学，新西伯利亚国立大学。该校与莫斯科大学和新西伯利亚国立大学在国际关系学，学术交流方面有着密切的关系。
俄罗斯托木斯克国立大学，师资力量雄厚，有5000多名讲师，其中有600名教授，800名副教授，50名俄罗斯国家科学院院士，2名诺贝尔奖获得者，25名俄联邦国家基金获得者，295名博士后和800名博士在校任教。大学毕业生有100名获得前苏联国家科学院和俄罗斯国家科学院院士称号，50名毕业生获得过前苏联列宁科学教育基金。
2005年该大学获得了National Quality Assurance公司（英国国家质量保证有限公司）颁发的关于托木斯克国立大学质量管理体系符合国际标准ISO 9001：2000的证书。
2010年，托木斯克国立大学在“高校发展计划”选拔竞赛中脱颖而出，被确定为“国家研究型大学”，成为俄罗斯15名校之一。
2014年，托木斯克国立大学成功成为世界排名第273的大学。
2015年，托木斯克国立大学成功成为世界排名第303的大学。
大学设有23个论文评议委员会，其中13个是博士论文答辩委员会。托木斯克大学经过125年发展历程，在校生2.2万人，拥有22个系、5所分校，西伯利亚地区德国设有45个入学培训中心，35个科研实验室，另外还有西伯利亚植物园（建于1880年）、科学图书馆、出版社、文化中心、健身房和世界水准的游泳池、露天大型运动场、保健院等设施，可供师生实践和娱乐。
托木斯克国立大学所属的西伯利亚植物园建立于1880年，是西伯利亚最古老的植物园，占地128公顷，温室面积6500平方米，6000多种植物。该大学专业唱诗班和小提琴合奏团闻名于俄罗斯和海内外。校史博物馆建于19世纪初，分为：标本馆、动物博物馆、矿物陈列馆、珍贵书籍文献馆、古生物学博物馆、考古学及民族学陈列馆和物理发展史博物馆。托木斯克国立大学与国外大学联合办学已有悠久的历史。它是西伯利亚第一个开放性大学，也是第一个接受世界各国资助的学校。它的藏书和博物馆里陈列的物品来自欧洲、亚洲、美洲等不同的国家。